Misi Program Studi Administrasi dan Kebijakan Kesehatan terdiri dari:

1. Melaksanakan pendidikan secara profesional, berorientasi terhadap kebutuhan masyarakat berdasarkan pada nilai dasar Program Studi Magister Administrasi dan Kebijakan Kesehatan, untuk menghasilkan lulusan yang berjiwa leadership;
2. Melaksanakan dan memfasilitasi penelitian untuk pengembangan keilmuan bidang AKK, dalam upaya menghasilkan lulusan yang kompeten sebagai akademisi, peneliti, dan konsultan;
3. Mengembangkan dan memperkuat networking dengan institusi pelayanan kesehatan, institusi lain yang terkait, dan masyarakat dalam rangka memberikan kesempatan pada peserta didik mengimplementasikan ilmu AKK;
4. Menerapkan metode residensi, magang dan benchmarking dalam upaya peningkatan pemahaman dan profesionalisme dosen dan peserta didik dalam pengelolaan pelayanan kesehatan.